Le parcours du musée englobe le monde arabe dans ses dimensions culturelles, religieuse, sociale, anthropologique. Il suit le fil d’une histoire, en abordant successivement cinq thèmes : Les Arabies, Sacré et figures du divin, Les villes arabes, La beauté et Le temps de vivre. Un nouvel accrochage remet à l'honneur la création dans le monde arabe depuis la seconde moitié du XXe siècle, et la fait dialoguer avec les œuvres et les objets du passé.